- Myasthénie.- Test à la prostigmine pour le diagnostic de la myasthénie.- Décurarisation post-opératoire (après curarisation par curares non dépolarisants).

- Hypersensibilité à la néostigmine.- Asthme.- Maladie de Parkinson. - Obstruction mécanique des voies digestives et urinaires.- Allaitement : il n'y a pas de données concernant le passage de la néostigmine dans le lait maternel. Il est vraisemblable que ce passage est faible, compte tenu de la structure de la néostigmine (ammonium quaternaire ionisé) et par analogie avec la pyridostigmine. Par mesure de précaution, il est préférable de suspendre l'allaitement en cas d'utilisation ponctuelle de néostigmine. En cas de myasthénie maternelle, l'allaitement est contre-indiqué en raison du passage dans le lait des anticorps récepteurs cholinergiques.